这场被称为伦敦最后一次大瘟疫开始于1665年春天，大约一年后结束。官方统计的死亡人数超过68,000人，但许多人认为死于鼠疫的人数接近10万人。在此期间，伦敦人经历了一个又一个难以想象的恐怖。家人都死了，尸体经常被扔到街上，直到他们被埋葬者捡起来，死亡的气味无处不在。这是人间地狱，许多人认为这将是所有时代的终结。
1.守秘
在鼠疫爆发之初，当死亡人数开始显著增加时，疫情就被公开减到最低。这是因为英国不想中断海外贸易。如果瘟疫的消息传到其他港口，英国船只将被拒绝入境，贸易将陷入停滞。然而，伦敦较为富裕的居民对发生的事情非常了解，他们收拾行囊，前往英国，希望能逃脱这场致命的瘟疫。其他居民只是忽视了鼠疫的早期迹象，并一如既往地保持着社交活动。
2.不允许离开
虽然伦敦富有的居民在瘟疫开始时能够逃出来，但穷人就没那么幸运了。随着死亡人数持续上升，许多生活在贫困中的人不想冒失去工作或放弃狭小公寓的风险。这是他们唯一的生活，除了伦敦以外，他们一无所有。当死亡人数达到每周数百人的时候，越来越多的穷人决定冒着一切危险离开伦敦前往英国。唯一的问题是，到那时(1665年6月)，穷人已无法获准离开伦敦。任何想要离开伦敦的人都必须得到证明，证明他们没有鼠疫，并且允许离开。市长大人停止发放这些文件，造假者以高昂的费用提供假文件。穷人再一次遭受痛苦。
3.闭门不出
枢密院发布的一项瘟疫命令中说，任何有被鼠疫感染的人房子都必须关闭。整个家庭不得不呆在房子里，无论是否生病，总共40天。然后在门上画了一个红十字会，警告其他人说里面的人患了鼠疫。这是一个有争议的命令，因为许多人认为这是对仍然健康的家庭成员的自动死刑。纳撒尼尔·霍奇斯(Nathaniel Hodges)是大瘟疫时期的一名医生，他认为该命令增加了死亡人数，但他无力反对。为了更大的利益，那些患有鼠疫的人和接触到鼠疫的人被从普通人群中清除。有报道称，有小孩的家庭被关在家里。有时，父母不得不忍受孩子的死亡。有时，父母先死，邻居们透过窗户看着孩子们一个接一个地死于瘟疫或饥饿。到1665年9月，隔离已无法进行。太多的人生病和死亡。
4.直到他们得了鼠疫
在一次可怕的隔离中，一个家庭被关在家里40天，因为他们的女仆的皮肤上有斑点。她的病情有所好转，但在隔离结束、家人接受检查之前，她的家人是不允许离开家的。当时，这家的女主人因为关在家里太久而发烧，所以这家人不得不再接受40天的隔离。在第二次隔离期间，更多的家庭成员患病。没有新鲜的空气，没有锻炼，被迫盯着风景看，难怪会有健康问题。这家人再次接受了检查，发现病了，又进行了一次隔离。然而，这一次，一个视察过这所房子的人把可怕的瘟疫带了进来。大多数家庭都死了。
5.伊姆
当人们在伦敦的家中被隔离时，一批脏衣服被运到德比郡的伊姆村。它是从伦敦运来的，带着瘟疫。人们开始在E伊姆生病，唯一能控制它的方法就是隔离他们自己。村长威廉姆佩松(William Mompesson)帮助人们进行了自我隔离，以免瘟疫传播到其他村庄。村长的妻子和村里大约80%的人口死于鼠疫。
6.被屠杀的猫狗
由于不知道鼠疫是由在受感染的老鼠身上发现的跳蚤传播的，一个谣言在伦敦传开说它是由猫和狗引起的。听到这个谣言，市长下令杀死所有的猫和狗。他一点也不知道猫和狗帮助减少了老鼠的数量，而且通过命令这些食肉动物被杀死，他可以使鼠疫更容易传播。据估计，超过20万只猫和大约4万只狗被屠杀。
7.梅毒被认为可以预防鼠疫
17世纪中期的医生们迷信医学。他们拼命地努力去了解科学医学世界，但是没有我们今天所拥有的设备，这些早期的医生注定要一次又一次地失败。在伦敦的最后一次大瘟疫期间，有记录表明梅毒被认为对鼠疫具有免疫力，就好像一种邪恶会抵消另一种一样。尽管这个古老的谣言没有任何真实性，但医生们并没有对此提出异议。事实上，他们中的许多人似乎觉得身体能更好地“摆脱”这种疾病，而不是只能够抵御一种致命的疾病。在他们的想法中，这两种“毒药”会互相争斗，让身体不受伤害。
